[qson]

Du måste förmodligen tala om för webbläsaren att det är utf8.
Gör det med "Content-type"-huvudet:
Content-type: text/html; charset=utf8

Detta kan du göra i t.ex. .htaccess-filen alternativ lägga in en meta-tagg (vanligast):
<meta http-equiv="Content-type" content="text/html; charset=utf8" />

Har du redan detta, så kan det kanske bero på din ftp-klient som eventuellt skickar filerna som ASCII istället för binärt. Ändra det, så du skickar binärt.