[ejick]

Med tanke på att koden du skickar inte validerar (http://validator.w3.org/) som den ska kan det ju vara, och är ganska praktiskt överlag, att öppna pdf-filen i ett nytt fönster.

I ditt fall använder du doctype: XHTML 1.0 transitional vilket ska tillåta att du använder "target="_blank" på dina länkar för detta ändamål.

Om du inte vill göra förstora ändringar i koden för detta kan du ändra window.location och istället ha window.open().

Dock är det inget svar på din fråga, vilket jag tror kan bero på lite olika faktorer... men det är ett förslag på en annan (bättre) lösning.