[edited]

*Har du något publiceringsverktyg? Joomla, wordpress etc?
Inget open source system, allt är skräddarsytt.

*Har du kollat loggarna? Förslagsvis för både system och webbserver.
Hittar inget konstigt där

*Har du kollat filsystemet? Har filer ändrats? När och av vilken användare (www-data? din användare? root? en okänd användare?)
Inga filer har ändrats, mer än själva publikationerna som laddas upp dagligen har ändrats, bara några fåtal korrigerar för att trimma upp det hela lite. Men inga ändragar gjorda av någon annan än mig, inga ändringar på datum etc.

Vad gäller det här med säkerhetshål, menar du att något fel i webbläsare eller pluginer/tillägg kan vara en källa till att skapa ett sådant här problem?

Något du själv har varit med om?