Tack för era svar!
Jag måste nog förtydliga en sak, det är alltså fråga om ETT stort företag och inte flera. Det är inte så troligt att det blir någon mer än denna branding. Dvs. det ska endast finnas två siter och vi behöver inget cms-liknande system.
Vår lilla tjänst är endast en väldigt liten del av detta företags hela webbsida.
MEN.. Det är fortfarande vår tjänst och det ska endast stå "Företaget i samarbete med xxxx". Så det är ingen hemlighet att det är vår tjänst de använder och inte företagets. Lite svårt att förklara utan att berätta allt, men det är för tidigt ännu
Det där med att köra en subdomän och sedan länka till exakt samma filer kanske vore något istället för att ha två websites i IIS:en. Vilka css-filer, bilder, layout osv man använder avgörs ju ändå av t.ex. subdomänen. Detta måste ju vara en helt ok idé ?
Det här med duplicate content är ju en superviktigt fråga. Om man kör som du föreslog BjörnJ, då försvinner väl all "SEO-kraft" som skapas utifrån subdomänen?