[tydal]

Jag jämförde tiden det tog att öppna i fil som låg i en katalog direkt under roten mot en fil som låg i en katalog sex nivåer under roten. Det gick faktiskt lite snabbare att öppna filen som låg närmare roten, men det rörde sig om tre hundradelssekunder då jag öppnade tusen filer på en gång.

Det tog 0,12 sekunder att öppna tusen filer i en katalog direkt under roten.
Det tog 0,15 sekunder att öppna tusen filer i en katalog som låg sex kataloger under roten.

Skulle din server behöva pumpa ut tusen filer samtidigt så är nog inte den här tidsförlusten på 0,03 sekunder något som märks.

Så, sammanfattningsvis, nej, det är ingen prestandamässig fördel. Det är bättre att ha en vettig katalogstruktur så man håller ordning på sakerna.