Jag skulle nog säga FreeBSD framför Red Hat. Det kanske bara är en känsla jag har, men jag tycker att FreeBSD känns mer 'moget' (främst därför att det har utvecklats under en längre tid).
En inte helt neutral skrift som har några år på nacken, men som ändå intressant och tänkvärd (speciellt avsnittet om säkerhet):
http://people.freebsd.org/~murray/bsd_flier.html