Jag har testat och använder dagligen e-butik och oscommerce (på flera olika shoppar) och dom skiljer sig enormt mycket.
E-butik - extremt enkelt men vill du ha specialanpassade lösningar så får du betala för det. Dom har två olika paket där det mindre inte stödjer vissa självklarheter som produktimport vilket den mer avancerade versionen stödjer - men det kostar också.
Oscommerce - Helt gratis, open source, tack vare en hel drös men duktiga användare så finns i princip alla funktioner som du kan tänka dig att ladda ner helt gratis. Jag har lyckats modifiera och lägga till ganska avancerade funktioner utan att kunna ett uns php... Rekommenderas!
(
http://www.oscommerce.com/community/contributions)