Nu är mitt förslag varken gratis eller gjord för att göra backup på din egna externa hd, Men jag tycker att den är värd att nämnas:
Kolla in Jungle Disk
http://www.jungledisk.com/
Det kostar lite men är så himla bra och plattformsoberoende, du kan jobba med din "hårddisk" överallt och på vilket os som helst och backup sker per automatik så fort en fil ändras eller läggs till.