Ser ut som att du har fått en släng av "the guillotine bug".
http://www.positioniseverything.net/...uillotine.html
I just ditt fall beror det på att du lagt in StatCounter-scripten på fel ställe. Dessa skriver ut en "ofloatad" och "oclearad" span (.statcounter) under de två floatade elementen (#main och #secondary) i container-diven (#content) och därav din guillotine-bugg.
En lösning är att flytta statcounter-scripten in i någon av divvarna #main eller #secondary.
En annan lösning vore att sätta en div med clear:both runt scripten. Finns såklart fler lösningar... men nu är du förhoppningsvis medveten om problemet.
