Hittade "felet" till slut
Resultatet från AJAX-anropet läggs i en div-struktur (kan man säga så?) där botten-diven har en genomskinlig PNG-bild som bakgrund.
Byter man den bakgrunden till en fast färg så funkar länkarna även i IE6.
Men det är något som beror på AJAX-anropet eftersom det går bra att hårdkoda in en A-tag mot den genomskinliga PNG-bilden, då går det att klicka.
Jaha, då är det dags att klura ut hur man ska lura IE