Jag har inte jobbat med just HtmlAgilityPack men du hämtar ju bara htmlfilen och sparar den. Strukturen i html-filen kan, strukturmässigt, ses som en xml-fil och jag antar att det ger samma åtkomst.
Jag tror inte att det sker någon som helst konvertering till ett mer "ren" xml varav din förvirring
