Jag har precis arbetat med en Open Sorce spelare som heter JW Player. Många använder den.
Den klarar av .flv, mpeg4 och en del andra format.
Det är bra om man har lite flash-kunskaper så man kan göra om utseendet för spelaren. Standardutseendet tycker i alla fall jag är lite tråkigt.
http://www.jeroenwijering.com/?item=JW_FLV_Player