Som jag förstod frågan gällde det inte hur man ansluter till och använder MySQL i koden till sidorna, utan hur man kan arbeta i databasen direkt från Visual Studios Server Explorer precis som man gör med MSSQL. Jag har själv funderat över detta tidigare, men inte haft tid att undersöka saken närmare.
Men lite googlande gav ganska snart resultat. Ladda ner och installera Connector/Net 5.2 från MySql (
http://dev.mysql.com/downloads/connector/net/5.2.html) så funkar det. Jag har inte hunnit prova så mycket än, men det ser lovande ut i Visual Studio 2008.