Du fixar enklast PNG bilderna i IE 6 och under genom att skapa en separat css fil.
Jag antar att du redan använder css för att styra din nuvarande layout, om du inte gör det så bör du det. För om du har en bra handledare/lärare så kommer han eller hon antagligen kolla på hur du har "kodat" sidan.
Det enklaste är som sagt att skapa en separat css fil där du lägger alla dina hack för IE, link taggen placerar du sedan i en conditional comment för IE 6 och under som gör att andra browsers ignorerar den.
Om du inte vet vad conditional comments är kan du kika här:
http://www.quirksmode.org/css/condcom.html
För AlphaImageLoader ("PNG fix") kan du kolla här:
http://msdn2.microsoft.com/en-us/library/ms532969.aspx
Och om du använder PNG-bilder i html koden finns en automatisk "PNG fix" i JS här:
http://homepage.ntlworld.com/bobosola/pnghowto.htm