Hej,
Kan vara många olika anledningar samt en kombination av desamma. Helst ska det vara så små ändringar som möjligt så att man knappt märker att det är ett nytt system.
1. HTML-strukturen i största allmänhet. Ser sidmalllar likadana ut i Magento eller har ni gjort en redesign också?
2. Meta-info. Även om de tidigare var automatgenererade så bör de i alla fall till att börja med vara identiska i Magento också.
3. Laddtid. Har ni optimerad Magento-hosting? Laddar sidan lika bra som tidigare, är caching uppsatt på bästa sätt. Magento i sig självt är ju långsamt och segt.
www.gtmetrix.com är bra för diverse tester.
4. XML sitemap uppe för nya sidan?
Här är en bra länk (på engelska) med diverse tips att tänka på,
https://paulnrogers.com/pre-post-mig...ento-websites/
Lycka till!