Om man har en Joomla 3 sajt finns det gratis extensions som gör det på sajten. Jag har för mig att det finns minst två alternativ;
Wemahu.
http://extensions.joomla.org/extensi...otection/25989
Centrora Security:
http://extensions.joomla.org/extensi...otection/27813
Sedan finns Jamss - ett enkelt skript, som dock inte är specifikt, men borde gå att använda till annat. Mycket enkelt att köra:
http://forum.joomla.org/viewtopic.php?f=621&t=777957
Sedan för Joomla finns estensions som Eyesite. Man kör Eyesite när sajten är ren och då checkar den varje fil och lagrar resultatet i en databas. Sedan kör man Eyesite varje dag och får besked om nya eller ändrade filer. På så sätt kan man upptäcka skadlig kod.