1: Spelar det någon roll om de inlänkar jag får länkar till "exempel.se" eller "www.exempel.se"?
Ja, du bör som sagts i tråden göra en 301-redirect till den du väljer, för att länkkraften ska samlas, google ser nämligen detta som två olika domäner.
2: Finns det någon anledning att ändra detta till "www.exempel.se" eller kan det lika gärna vara som det är?
Ja, en anledning är att man oftast skriver www när man länkar, så de flesta naturliga länkarna riktas mot denna, plus att många fortfarande skriver in detta i adressfältet.. Men du väljer själv 
3: Om det finns anledning att ändra till "www" och jag gör det, kommer detta påverka Google rankningen när ändringen genomförs?
Nej, ifall du inte har några inlänkar, och har du inlänkar så löser du det med 301 redirect.. Så bör det inte bli någon påverkan.