Har ingen aning om hur man bäst löser det i Wordpress, men...
<a href="http://www.målsida.se" onclick="document.location.href='http://www.ful-affiliatelänk.här'; return false;" title="....">....</a>
(Du förlorar förstås intäkter från den promille av dina besökare som inte har Javascript aktiverat.)
Vill du dölja affiliatelänkar utan Javascript så får du använda dig av en länkförkortare (goo.gl, bit.ly, etc).