Du ska ha e-butiken som ingångssida och forumet på en underkatalog, t.ex.
http://example.com <-- ebutik
http://example.com/forum/ <-- forum (kan också ligga på forum.example.com, mer en smaksak även om underkatalogen ger bättre SEO då du lägger mer innehåll på samma domän).
"Alla" som letar efter forumet kommer att förvänta sig att det ligger som en underavdelning medan väldigt få kommer att hitta shopen om den ligger på en underkatalog/subdomän.
Visst, organisk söktrafik kommer att hitta butiken, men de som får en länk av någon kommer kanske att missa den.