Om excel filen är strukturerad väl så går detta att göra genom PHP.
Finns en hel del klasser ute på internet för att läsa igenom excel filer, en snabb googling gav mig detta resultat:
http://sourceforge.net/projects/phpexcelreader/
Då kan du köra en while loop, och för varje rad så tar du bara och adderar summan du vill tjäna, och sedan adderar momsen. När du gjort detta lägger du in det i din databas.