Kör du apache så kan du fixa det med mod_rewrite. Testa .htaccess i stil med
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} subdoman\.se [NC]
RewriteCond %{REQUEST_URI} !^/subdomanunderkatalog
RewriteRule ^(.*) subdomanunderkatalog/$1 [L]
och givetvis måste apache veta om att båda dina domäner har samma rotkatalog. Det fixar du med ServerAlias
<VirtualHost xxx.yyy.zzz.nnn:80>
DocumentRoot /docroot
ServerName mindoman.com
ServerAlias
www.mindoman.com
ServerAlias subdoman.se
ServerAlias
www.subdoman.se
</VirtualHost>