Full backup av mysql gör du via mysqldump. Om du är helt hundra på att ingen process ändrar i databaserna kommer det att gå bra, annars rekommenderas --single-transaction för Innodb-tabeller.
För att dumpa hela kataloger så rekommenderar jag tar för kataloger med många filer samt rsync för kataloger med ej så många filer.
Förslag på syntax finner du här:
http://www.crucialp.com/resources/tu...twork-copy.php
Tänk på att se till så att filskydd och ägandeskap bevaras så lång möjligt. Lite bökigt att rekonstruera efterhand!
Ta också en dump av /etc, finns mycket konfiguration där som du vill ha kvar som referens. (men dumpa inte tillbaka den på plats, lägg den nån annans stans)
För att lista installerade paket i Debian/ubuntu gör du dpkg --get-selections > lista.txt
Mail till virtuella mailboxar kan ligga lite varstans, pröva
sudo grep virtual_mailbox_base /etc/postfix/main.cf om du kör postfix.