Såsom jag förstår det vill du köra multipla behörigheter på servern och ge tillgång till olika personer att placera PHP-kod i sin mapp som inte skall påverka någon annans källkod?
Ta en titt på open_basedir om det PHP du skall syssla med:
http://se2.php.net/manual/en/ini.cor...i.open-basedir
Gäller det rent generellt på webbservern så rekommenderar jag istället någon module relaterad till Apache.
Lycka till!