Att adressen konverteras till puny code (xn--pple-1za.eu) är helt normalt, bara så du vet. En IDN-domän finns nämligen i två olika "versioner". Åäö-versionen och puny code-versionen (som inte innehåller åäö).
När man knappar in
www.äpple.eu så blir man tekniskt sett INTE redirectad till xn--pple.1za.eu då båda två är SAMMA DOMÄN. Svårt att förklara för någon som är ny till IDN-domäner, men när du bygger länkar till din IDN-domän så går det inte att bygga länkar till "äpple.eu" utan du måste bygga länkarna till "xn--pple-1za.eu".
Angående din fråga: jag är inte säker på hur man tar sig förbi det, men om jag inte minns fel så finns det ett wordpress plugin som hjälper dig med det. Gör en sökning på något i stil med "IDN" så får du nog upp ett par intressanta resultat.
Äger själv ett par hemsidor med IDN-domäner, och jag installerade för något år sedan ett plugin som gjorde så att åäö visades i adressfältet. Minns dock inte vad det heter.
EDIT: Anledningen till att det hos Binero skapas en mapp som säger /xn-pple-1za.eu är för att det inte går att använda speciella tecken som åäö hos tjänster som Binero. Du måste därför konvertera äpple.eu till puny code-versionen för att sedan kunna använda den korrekt.
Så är det även hos Google Analytics. Du kan inte lägga in din domän i åäö-format utan du måste konvertera den till puny code först.