Är det många element så kör jag med slice-verktyget då man enkelt kan namnge alla olika delar så man hittar dom lättare senare. Men är det, som du säger, ett fåtal element så kan man lika gärna köra crop tool eller slå ihop alla lager till ett och spara ner del för del.
Just Slice Tool använder jag om jag ska skära ut små sektioner, bakgrundsskuggor m.m. Brukar stänga av/toggla lager för att få opaciteten och oönskade element/textfält på bilderna.
En sak du ska komma ihåg är att du inte ska spara saker i bilder OM du kan göra det i CSS istället. T.ex en stor svart ruta är ingen idé att spara ut som en bild, men det kanske du redan hade förstått?
Lycka till!