För din utvecklingsserver lär du knappast behöva ändra den där typen utav saker.
För en produktionsserver kan det vara aktuellt att pilla på inställningar som rör cache och hur mycket minne mysql skall allokera.
Ta en titt på
http://www.databasejournal.com/features/my...10897_3110171_1 för mera information om query cachen.
Du får ha i åtanke att precis som du säger så förutsätter manualen till mysql en del förkunskaper, framförallt i ämnet SQL och hur man hanterar sitt OS. Dokumentationen är skriven för att folk med kunskaper om databaser skall kunna installera och använda MySQL.
Testa att gå en kurs på ditt lokala universitet/högskola eller läs en bok om databashantering.