Helt otroligt, efter fyra timmars sökande slänger jag upp denna tråd...och löser problemet 2 min efteråt!
Tänkte åtminstone inte låta denna tråd bli oavslutad så här är lösningen:
InnoDb stödjer inte FULLTEXT vilket MyISAM gör. Trots att jag tyckte mig ha angett MyISAM som tabell (på många olika sätt) så verkar det ha blivit satt till InnoDB ändå.
Jag löste detta genom att ändra i my.conf . Där fanns det en rad som sa att default table var InnoDb, denna ändrade jag till MyISAM. Startade om Mysql och sedan fungerande det.
Återstår bara pip-ljudet