Lägger du GAd på förstasidan eller "singelpage" kommer du inte använda WP:s ultimala kapacitet för att exponera reklam. Låt förstasidan bli helt och hållet, möjligtvis lägg reklamen i höger, eller vänsterspalten beroende på vad du har för tema.
Använd sedan
Google Adsense Plugin för att trycka in reklamen i texten. Ett måste dock är "read more"-funktionen på förstasidan, dvs på förstasidan av bloggen presenterar du bara "excerpts", vill läsare läsa hela blogginlägget så får denne klicka sig fram till innehållet där även reklamen kommer att ligga.
EDIT: glömde svara på din fråga: du måste även ändra sidan "single.php".