Jag gjorde en liten implementation med PHP för ett tag sedan...

"A tool for compressing JavaScript and CSS without disrupting your workflow. Reducing file size and the number of HTTP requests."

http://webcloud.se/article/PHPCompressAssets_02

Kör du t.ex. Java finns det möjlighet att automatiskt komprimera JS-filer m.h.a. jsmin och ett Ant-skript som körs när man bygger projektet för deployment. Ganska trevligt sätt att slippa tänka på det när man fått det att rulla.