En sak som kan ställa till det med Filezilla ibland är att den försöker köra fler parallella uppkopplingar än servern tillåter. Testa om det gör nån skillnad om du går in i inställningarna och sätter "Maximalt antal samtidiga uppkopplingar" till t ex 2.

Jag tackar för alla svar.
Servern är min egen vps, och den kör Debian 7, med ftp servern PureFTPd.

Provar nu att ställa in: "max antal anslutningar" 1.

Efter mycket om och men så fungerar det på sätt och vis.
Det verkar fungera om jag skickar via sFTP, men inte om jag skickar via FTP.

Det är iofs bättre att skicka via sFTP, men nu vill jag fortfarande veta varför jag inte kan.
Någon som har en ideé?